Şişe kültürünü sallayınsuş taraması ve kültür (pilot test) aşamasındadır, kültür koşulları fermantasyon üretim kültür koşullarına mümkün olduğunca yakın olmalıdır, iş yükü büyük, uzun süreli, karmaşık bir işlemdir.Çalkalama şişesi kültürünün yüksek verimliliğini etkileyen faktörler esas olarak kültür sıcaklığı, çalkalayıcının çalkalama genliği, çalkalama şişesinin miktarı, kültür ortamının pH'ı, ortamın viskozitesi vb.'dir. Kültür sıcaklığı: miselyum büyüme sıcaklığı farklı yenilebilir mantarların türleri de farklıdır, uygun büyüme sıcaklığının çoğu 22 ℉ ile 30 ℉ arasındadır, kültür sıcaklığı çok düşükse misel büyümesi yavaştır;Sıcaklık çok yüksek olduğunda miselyum topakları gevşek ve seyrekleşiyor, miselyum topaklarının canlılığı ve kalitesi düşüyordu.

Çalkalama sıklığı ve yüksek verimli çalkalama şişesi yüklemesi: yenilebilir mantarlar aerobik mantarlardır, sıvı kültürdür, esas olarak kültür ortamında çözünmüş oksijenin emilmesiyle sağlanır.Kültür ortamındaki çözünmüş oksijen esas olarak ortamın viskozitesinden, kaptaki sıvı miktarından, salınım frekansından ve diğer faktörlerden etkilenir.Çalkalama frekansı büyüktür, çalkalama şişesi küçüktür, ortamın konsantrasyonu yüksektir, ortamın çözünmüş oksijeni yüksektir ve bunun tersi de düşüktür.Genellikle döner çalkalayıcı hızı 180-220 RPM/dak, ileri geri hareket 80-120 RPM/dak, genlik 6-7 cm'dir.

Kültür ortamının pH'ı: Kültür ortamının PH'ı besin emilimini, enzim aktivitesini ve misel pelet büyümesini doğrudan etkiler.Spesifik pH, sterilizasyondan önce ayarlanmalıdır, çoğu yenilebilir mantarın pH'ı 2,0-6,0'dır.Kültür ortamındaki PH'ın ciddi değişimini önlemek için, kültür ortamına sıklıkla kalsiyum karbonat, fosfat ve diğer tampon maddeler eklenir.

Orta viskozite: Orta viskozite, içinde çözünen oksijen miktarını doğrudan etkiler ve ayrıca misel topaklarının oluşumunu da etkiler.Sonuçlar, kültür ortamının viskozitesi arttığında miselyum peletlerinin çapının azaldığını, sayının arttığını ve verimin arttığını gösterdi.Bu nedenle miselyum peletlerinin çapındaki sıvı suşların gereksinimlerine göre belirli bir viskoziteye sahip kültür ortamı yapılandırılmalıdır.Hücre kültürü titiz bir çalışmadır, özellikle yüksek verimli çalkalayıcı gibi bir çalkalayıcı yardımıyla kültürlenmesi gerektiğinde, hücre kültürünün sorunsuz ilerlemesini sağlamak için daha kapsamlı ele alınmalıdır.